20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3372 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  921    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  39.73 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  24.24 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  24.67 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  23.9 
 
 		 487 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  23.47 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  24.29 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  22.48 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  21.64 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  23.77 
 
 		 481 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  24.68 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  24.23 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  23.93 
 
 		 417 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  22.36 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  21.26 
 
 		 468 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  22.05 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  21.94 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  23.92 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  21.96 
 
 		 489 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  24 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>