19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1664 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  988    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  48.05 
 
 		 495 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  46.77 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  45.75 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  39.1 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  25.11 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  24.36 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  21.05 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  22.48 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  18.3 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  20.05 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  21.15 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  20.92 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  22.04 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  21.1 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  20.49 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  19.44 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  18.65 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  21.08 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>