20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0126 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  920    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  41.94 
 
 
417 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  41.69 
 
 
417 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  40.35 
 
 
428 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  25.76 
 
 
446 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  23.95 
 
 
487 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  23.18 
 
 
483 aa  156  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  23.36 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  24.08 
 
 
455 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  24.36 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  22.48 
 
 
495 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  21.52 
 
 
488 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  21.15 
 
 
468 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  20.53 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  20.68 
 
 
481 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  21.92 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  20.75 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  21.46 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  21.56 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  21.34 
 
 
495 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>