23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2797 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  866    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  70.74 
 
 
417 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  70.02 
 
 
417 aa  618  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  40.64 
 
 
454 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  22.27 
 
 
446 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  22.22 
 
 
487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  22.56 
 
 
464 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  19.71 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  24.68 
 
 
455 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  24.16 
 
 
488 aa  88.2  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  22.1 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  19.62 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  22.66 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  20.42 
 
 
489 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  21.58 
 
 
495 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  19.3 
 
 
484 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  22.2 
 
 
457 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  18.12 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  20 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  23.53 
 
 
513 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  22.14 
 
 
511 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  22.35 
 
 
492 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  22.19 
 
 
511 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>