20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1196 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  88.97 
 
 		 417 aa  756    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  835    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  70.65 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  41.69 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  22.61 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  22.17 
 
 		 446 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  23.81 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  20.85 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  23.93 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  21.29 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  22.04 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  22.46 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  22.1 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  20.97 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  21.3 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  21.15 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  21.03 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  23.49 
 
 		 511 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  22.5 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  22.34 
 
 		 513 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>