17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1964 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  89.45 
 
 		 511 aa  916    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  73.24 
 
 		 520 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  60.47 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  56.73 
 
 		 518 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  56.7 
 
 		 518 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  52.9 
 
 		 544 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  20.25 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  23.53 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  20.43 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  24.33 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  22.68 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.88 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  27.1 
 
 		 417 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  20.9 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  21.43 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  22.22 
 
 		 457 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>