16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0265 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  874    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.27 
 
 
487 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  25.86 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  20.27 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  21.46 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  21.76 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  21.71 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  24.44 
 
 
520 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  22.71 
 
 
511 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  22.73 
 
 
511 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  23.55 
 
 
518 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  23.76 
 
 
451 aa  50.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  19.94 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  16.04 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  19.35 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  21.08 
 
 
484 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>