18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3425 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  89.45 
 
 		 511 aa  878    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  62.43 
 
 		 513 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  74.27 
 
 		 520 aa  768    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  57.5 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  56.7 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  53.12 
 
 		 544 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  20.58 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  22.01 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  20.65 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  23.08 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  22.71 
 
 		 457 aa  51.2  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.62 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  22.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  21.66 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  23.6 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  17.6 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  21.55 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>