15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6214 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1080    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  59.34 
 
 		 518 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  59.53 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  59.19 
 
 		 518 aa  554  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  52.19 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  53.36 
 
 		 511 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  49.9 
 
 		 520 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  20.4 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  22.05 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  20.9 
 
 		 444 aa  73.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  23.55 
 
 		 451 aa  62  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  20.12 
 
 		 468 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  22.62 
 
 		 487 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  22.03 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  18.78 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>