18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2169 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1020    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  62.43 
 
 		 511 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  63.76 
 
 		 518 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  60.47 
 
 		 511 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  57.82 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  58.06 
 
 		 518 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  59.53 
 
 		 544 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  21.41 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  18.89 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  23.5 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  20.4 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  19.74 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.9 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  23.53 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  17.75 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  24.59 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  20.72 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  23.9 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>