18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1235 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  993    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  45.3 
 
 
495 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  42.38 
 
 
481 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  39.1 
 
 
484 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  42.04 
 
 
492 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  26.07 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  22.67 
 
 
483 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  23.47 
 
 
455 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.81 
 
 
487 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  21.52 
 
 
454 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  18.98 
 
 
446 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  21.35 
 
 
444 aa  89.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  24.16 
 
 
428 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  23.72 
 
 
417 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  22.46 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  24.44 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  20.75 
 
 
468 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  21.32 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>