33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0090 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  315  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  63.4 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  52.94 
 
 
155 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  53.59 
 
 
153 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  52.94 
 
 
155 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  52.94 
 
 
155 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  51.3 
 
 
155 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  54.61 
 
 
152 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  48.68 
 
 
153 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  51.97 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  50.66 
 
 
152 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  50.66 
 
 
152 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  50.66 
 
 
152 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
152 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  39.72 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  43.65 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  43.2 
 
 
147 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  38.69 
 
 
144 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  35.29 
 
 
144 aa  97.1  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  37.98 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  32.76 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3182  acetyltransferase  26.52 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  27 
 
 
141 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  27.72 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2631  acetyltransferase protein  29.17 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  27 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  27 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.945027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>