29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0127 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  100 
 
 		 156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  63.4 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  50.98 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  47.74 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  47.74 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  47.74 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  48.39 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  48.68 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  47.37 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  46.71 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  47.37 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  42.86 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  44.09 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  44.88 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  45.95 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  39.37 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  36.61 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  31.07 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  28.69 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  28.71 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  27.87 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  28.71 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2631  acetyltransferase protein  27.96 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  29.41 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>