22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0067 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  48.32 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  50.74 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  46.38 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  43.8 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  40.85 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  44.88 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  40.65 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  41.46 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  43.1 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  39.84 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  44.76 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  39.84 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  39.02 
 
 		 152 aa  95.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  42.02 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  35.96 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>