34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001918 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  84.03 
 
 
144 aa  250  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  57.75 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  50.74 
 
 
147 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  42.76 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  44.14 
 
 
155 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  44.03 
 
 
152 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  42.07 
 
 
155 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  42.07 
 
 
155 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  43.28 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  42.86 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  44.96 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  42.54 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  45.24 
 
 
152 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  40 
 
 
153 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
154 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  45.95 
 
 
156 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  39 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0188  TDP-fucosamine acetyltransferase  31.03 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
364 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0518  TDP-fucosamine acetyltransferase  31.03 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4027  TDP-fucosamine acetyltransferase  31.03 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  30.53 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1149  acetyltransferase  30.16 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
193 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0870  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
159 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0989  acetyltransferase  23.24 
 
 
166 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137577  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2631  acetyltransferase protein  25.19 
 
 
140 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>