27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4259 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  100 
 
 
152 aa  313  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  96.71 
 
 
152 aa  302  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  96.05 
 
 
152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  96.05 
 
 
152 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  84.21 
 
 
155 aa  268  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  83.55 
 
 
155 aa  267  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  83.55 
 
 
155 aa  266  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  80.26 
 
 
155 aa  256  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  81.58 
 
 
152 aa  256  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  52.63 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  57.62 
 
 
152 aa  157  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  51.97 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  47.37 
 
 
156 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  46 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  46.62 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  44.03 
 
 
144 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  45.99 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  43.28 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  41.46 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  32.69 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2631  acetyltransferase protein  26.27 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
183 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  43.75 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>