22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0127 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  100 
 
 		 153 aa  309  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  53.95 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  53.29 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  53.29 
 
 		 155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  53.29 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  52.63 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  51.32 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  51.97 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  50.98 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  53.59 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  51.32 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  51.32 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  48.68 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  46.85 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  40.85 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  42.42 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  37.5 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  32.14 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>