27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4074 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  99.35 
 
 
155 aa  313  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  99.35 
 
 
155 aa  313  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  86.45 
 
 
155 aa  274  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  83.55 
 
 
152 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  84.21 
 
 
152 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  82.24 
 
 
152 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  81.58 
 
 
152 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  81.58 
 
 
152 aa  255  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  58.82 
 
 
152 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  53.29 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  52.94 
 
 
154 aa  158  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  47.74 
 
 
156 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  45.33 
 
 
153 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  46.62 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  44.83 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  42.07 
 
 
144 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  45.6 
 
 
152 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  39.84 
 
 
147 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  43.37 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2631  acetyltransferase protein  26.27 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5271  hypothetical protein  37.74 
 
 
264 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  38.03 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
183 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>