34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0454 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  31.13 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  34.44 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  36.28 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  34.11 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  30.32 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  34.11 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  34.11 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  33.85 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  28.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  36.47 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  33.65 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  33.71 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 		 213 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.268163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1723  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  30.25 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.173475 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1733  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  29.41 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1736  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  29.41 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.771756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1542  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  29.41 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  35.24 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0266  acetyltransferase-like  30.77 
 
 		 223 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.879023  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  33.33 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01199  acetyltransferase, gnat family  42.11 
 
 		 310 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>