26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4716 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  86.45 
 
 		 155 aa  275  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  86.45 
 
 		 155 aa  274  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  86.45 
 
 		 155 aa  273  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  80.92 
 
 		 152 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  80.26 
 
 		 152 aa  256  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  78.95 
 
 		 152 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  78.95 
 
 		 152 aa  253  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  75 
 
 		 152 aa  236  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  51.32 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  55.92 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  51.3 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  48.39 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  44.67 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  44.14 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  45.86 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  40 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  46.09 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  43.1 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  41.49 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  34.04 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2631  acetyltransferase protein  26.27 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  38.03 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 175 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>