25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00571 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  84.03 
 
 
144 aa  250  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  60.56 
 
 
143 aa  188  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  44.83 
 
 
155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  44.83 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  44.14 
 
 
155 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  43.8 
 
 
147 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  43.28 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  43.28 
 
 
152 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  43.57 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 
152 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  40 
 
 
155 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  38.93 
 
 
152 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  42.06 
 
 
152 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  39.37 
 
 
156 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  37.5 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  38.96 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  29.87 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
364 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
159 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>