35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3499 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3499  acetyltransferase  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0067  acetyltransferase, GNAT family protein  48.32 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  46.85 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0127  acetyltransferase  42.86 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4454  GCN5-related N-acetyltransferase  45.99 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4259  acetyltransferase  45.99 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000663671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0085  GCN5-related N-acetyltransferase  45.26 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00857587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  44.96 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4314  GCN5-related N-acetyltransferase  44.53 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000020352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4074  acetyltransferase  45.6 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000248969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3871  acetyltransferase  45.6 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3964  acetyltransferase  45.6 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000319492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3876  acetyltransferase  46.67 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000368122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000363939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4716  acetyltransferase  46.09 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00571  acetyltransferase  38.93 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0127  acetyltransferase  42.42 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000355757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4091  GCN5-related N-acetyltransferase  45.87 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  36.28 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2450  hypothetical protein  34.48 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00202962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.756848 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  23.42 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  31.48 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  30.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>