111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0870 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0870  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  331  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0830  acetyltransferase  86.79 
 
 
159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00814406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  87.42 
 
 
159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  58.06 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  58.06 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  55.13 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63350  GNAT family acetyltransferase  55.13 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0386363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5516  hypothetical protein  55.13 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 
165 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3570  acetyltransferase, GNAT family  50.99 
 
 
197 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  53.55 
 
 
161 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360352  normal  0.789976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3935  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0826  putative acetyltransferase  27.66 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.450111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0653  acetyltransferase  32.65 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0555  acetyltransferase  32.65 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0497  acetyltransferase, GNAT  32.65 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0587  acetyltransferase  32.65 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0714  acetyltransferase, GNAT family  32.65 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0643  acetyltransferase, GNAT family  32.65 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0499  acetyltransferase  31.63 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0655  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
180 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0625  acetyltransferase, GNAT family  31.63 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4712  acetyltransferase, GNAT family  31.63 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0798  putative acetyltransferase  28.21 
 
 
230 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
252 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  28.28 
 
 
154 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  28.78 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2638  putative acetyltransferase  21.6 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32833  predicted protein  29.73 
 
 
376 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.742524  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0552  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
209 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  28.97 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
287 aa  44.3  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0647  acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0552  acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0494  acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.226849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0496  acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0583  acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2170  acetyltransferase  42.59 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  30.19 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.84 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0497  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0709  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0621  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4718  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0639  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.68 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  34.48 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1517  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.27 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.97 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2952  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  23.38 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003263  histone acetyltransferase HPA2  24 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
154 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33679  predicted protein  36.84 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.121195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.58 
 
 
314 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  23.38 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2378  acetyltransferase  20.29 
 
 
174 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1853  acetyltransferase  40.74 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0961913  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1754  acetyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
326 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2555  acetyltransferase  20.29 
 
 
174 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808703  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
146 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0857  acetyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1498  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1146  acetyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0401  acetyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0312  acetyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2121  acetyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
139 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.85 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0200  acetyltransferase  22.52 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.05 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  33.8 
 
 
187 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
182 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3663  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  28.1 
 
 
294 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  33.8 
 
 
187 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
347 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  33.8 
 
 
187 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0356  acetyltransferase  33.8 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  33.8 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  33.8 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>