76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0017 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  330  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0019  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
160 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0014  GCN5-related N-acetyltransferase  40.52 
 
 
153 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
155 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0243  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1751  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0346  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4489  acetyltransferase  29.03 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1529  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3728  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0422  acetyltransferase  30.87 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02488  hypothetical protein  30.46 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3333  hypothetical protein  29.29 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.673075  hitchhiker  0.00810135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  28.77 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1313  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000303256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0586  hypothetical protein  28.77 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1379  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  27.63 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4949  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1014  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.683731 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0125  hypothetical protein  27.08 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003207  hypothetical protein  34.74 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.39966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146731  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  28 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3833  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2566  acetyltransferase  28.23 
 
 
282 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2579  acetyltransferase, GNAT family  28.23 
 
 
282 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000394368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2390  acetyltransferase  28.23 
 
 
282 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0672236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3024  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2290  acetyltransferase  25 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.410105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  29 
 
 
290 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
291 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
170 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3579  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
141 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.363377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  29.77 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13681  predicted protein  31.52 
 
 
323 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2343  hypothetical protein  21.82 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
343 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
149 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  32.22 
 
 
164 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
299 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000582767  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.25 
 
 
291 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2791  acetyltransferase, GNAT family  26.17 
 
 
282 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139926  hitchhiker  0.000000429249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0760  GCN5-related N-acetyltransferase  24.52 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4781  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
266 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112634  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
312 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2530  acetyltransferase, GNAT family  26.17 
 
 
282 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.82347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3234  acetyltransferase, GNAT family  29 
 
 
295 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.157565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2514  acetyltransferase  31.08 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0902749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2475  acetyltransferase  31.08 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000339819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2699  acetyltransferase  31.08 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2713  acetyltransferase, GNAT family  31.08 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000871829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2569  acetyltransferase  27.84 
 
 
282 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3465  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2622  acetyltransferase, GNAT family  24.77 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000149947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0090  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000177533  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14360  acetyltransferase  37.31 
 
 
188 aa  40.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3199  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>