More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2088 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2088  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 498 aa  1005    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.917173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  49.59 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  46.83 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  49.18 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.34 
 
 		 512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  48.77 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  48.77 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.67 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6712  Betaine-aldehyde dehydrogenase  51.89 
 
 		 479 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  47.96 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  49.8 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.07 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.02 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  47.14 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.54 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  47.53 
 
 		 493 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 		 490 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.34 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  45.96 
 
 		 497 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  47.14 
 
 		 493 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  44.85 
 
 		 494 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.85 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.72 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  47.01 
 
 		 488 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.05 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  43.32 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  46.73 
 
 		 493 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.85 
 
 		 494 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  46.04 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.58 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.58 
 
 		 488 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.79 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.03 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.51 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  46.79 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  47.41 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.23 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  46.82 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.23 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.23 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.08 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.74 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.87 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.05 
 
 		 487 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.68 
 
 		 496 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  44.11 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43 
 
 		 490 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0174  aldehyde dehydrogenase  47.14 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.98 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  44.15 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.01 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  46.14 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  46.49 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.25 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4152  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.83 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 483 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.82 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  47.23 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 		 492 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  41.57 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  43.3 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.97 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  42.89 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  44.82 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  43.9 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.32 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  40.61 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3848  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.33 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0362745  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  42.36 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  45.31 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  46.47 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3296  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.8 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.4 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.7 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.6 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.2 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>