More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0323 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
384 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486315  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5425  putative butyryl-CoA dehydrogenase  62.99 
 
 
384 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1883  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.12 
 
 
388 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.88 
 
 
392 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.788367  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2252  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.46 
 
 
386 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308045  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1281  butyryl-CoA dehydrogenase  36.47 
 
 
387 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.33384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.33 
 
 
379 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.97 
 
 
377 aa  215  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.59 
 
 
380 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.05 
 
 
380 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.19 
 
 
383 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.77 
 
 
380 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.23 
 
 
379 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.77 
 
 
379 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  35.31 
 
 
379 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  35.31 
 
 
379 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.15 
 
 
380 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  33.15 
 
 
379 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.51 
 
 
379 aa  210  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.54 
 
 
390 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
379 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3620  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.9 
 
 
397 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.57 
 
 
383 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  34.78 
 
 
376 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  34.78 
 
 
376 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.78 
 
 
376 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1901  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.25 
 
 
388 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14325  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3783  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.6 
 
 
378 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00216857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.86 
 
 
380 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  35.44 
 
 
378 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  34.51 
 
 
376 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  34.51 
 
 
381 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.51 
 
 
376 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  34.51 
 
 
376 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.51 
 
 
376 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.51 
 
 
379 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.86 
 
 
380 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  34.24 
 
 
381 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.04 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.22 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.15 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  34.24 
 
 
381 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.24 
 
 
376 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  34.42 
 
 
379 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.15 
 
 
379 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  34.42 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  34.42 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.9 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  34.42 
 
 
379 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  34.42 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.95 
 
 
392 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.86 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  34.15 
 
 
379 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  34.15 
 
 
379 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.52 
 
 
377 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  34.15 
 
 
379 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  34.15 
 
 
379 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1835  butyryl-CoA dehydrogenase  36.49 
 
 
379 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.571593  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.47 
 
 
385 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2558  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.63 
 
 
381 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  33.06 
 
 
387 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.68 
 
 
373 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  32.97 
 
 
381 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  33.42 
 
 
379 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.19 
 
 
382 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  32.97 
 
 
381 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  32.97 
 
 
381 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
381 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.16 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  31.98 
 
 
379 aa  189  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  31.79 
 
 
380 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.77 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.52 
 
 
388 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3301  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.22 
 
 
381 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  35.05 
 
 
377 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0617  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.47 
 
 
380 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
380 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.43 
 
 
381 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1483  butyryl-CoA dehydrogenase  35.41 
 
 
382 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.05 
 
 
383 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04330  Isovaleryl-CoA dehydrogenase 2, mitochondrial precursor, putative  33.42 
 
 
417 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.12 
 
 
378 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295515  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.16 
 
 
386 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.06 
 
 
381 aa  186  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.88 
 
 
379 aa  186  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000373  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  34.68 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.51 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.17 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.13 
 
 
382 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.98 
 
 
388 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2120  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.59 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000249127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.69 
 
 
383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.07 
 
 
379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>