More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2252 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2252  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
386 aa  782    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308045  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1281  butyryl-CoA dehydrogenase  50.52 
 
 
387 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.33384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.58 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
376 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
376 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  39.05 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
376 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.52 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.46 
 
 
384 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486315  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.05 
 
 
376 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  38.42 
 
 
380 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.27 
 
 
379 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  36.94 
 
 
379 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  36.94 
 
 
379 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.63 
 
 
379 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.01 
 
 
380 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
377 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  35.7 
 
 
379 aa  256  6e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1883  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.56 
 
 
388 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5425  putative butyryl-CoA dehydrogenase  37.66 
 
 
384 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.7 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.94 
 
 
379 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.36 
 
 
387 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.36 
 
 
389 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.79 
 
 
381 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 
379 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.17 
 
 
380 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  38.1 
 
 
417 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.57 
 
 
385 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.62 
 
 
379 aa  247  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.84 
 
 
380 aa  245  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.92 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.38 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350853  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1901  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.28 
 
 
388 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14325  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  36.41 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  37.04 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  38.12 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.84 
 
 
380 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  37.93 
 
 
379 aa  243  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.86 
 
 
390 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  36.44 
 
 
379 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3620  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.56 
 
 
397 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.14 
 
 
383 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.13 
 
 
387 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  36.44 
 
 
379 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.68 
 
 
386 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  36.91 
 
 
387 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.68 
 
 
379 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.7 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.92 
 
 
385 aa  239  6.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.32 
 
 
380 aa  239  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.43 
 
 
380 aa  238  9e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.47 
 
 
387 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.18 
 
 
389 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  36.44 
 
 
379 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  36.22 
 
 
382 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.31 
 
 
386 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  33.51 
 
 
379 aa  236  4e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  36.44 
 
 
379 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  36.17 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.9 
 
 
379 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.9 
 
 
379 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.24 
 
 
389 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  36.17 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.36 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.96 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  36.17 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  36.98 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.04 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  36.17 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.04 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.04 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  36.17 
 
 
379 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.15 
 
 
389 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.86 
 
 
384 aa  234  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  34.72 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.3 
 
 
378 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295515  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  35.82 
 
 
387 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.1 
 
 
387 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.13 
 
 
382 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  36.48 
 
 
390 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  35.82 
 
 
387 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.63 
 
 
389 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.75 
 
 
379 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000249127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.34 
 
 
390 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
378 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.14 
 
 
392 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.788367  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.34 
 
 
390 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.09 
 
 
390 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.53 
 
 
379 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.57 
 
 
384 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 
379 aa  229  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0901  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.96 
 
 
386 aa  229  9e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.41 
 
 
387 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1516  butyryl-CoA dehydrogenase  35.96 
 
 
386 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>