52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39110  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7005  hypothetical protein  63.78 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.452257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3728  hypothetical protein  46.07 
 
 		 186 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5960  Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)- like protein  41 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00069355  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  46.38 
 
 		 248 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  44.93 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  50 
 
 		 226 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  42.03 
 
 		 246 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  40.58 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  40.58 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  42.03 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.28 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  48.39 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  34.34 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  50 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.43 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  41.67 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  48.44 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  42.86 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  40.98 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  39.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  41.07 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.5 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  41.07 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 228 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.14 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  36.76 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  41.67 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 207 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  33.87 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  40.91 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  32.81 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  37.1 
 
 		 205 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 194 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  41.07 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  38.46 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  41.07 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  34.33 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  33.33 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>