21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3728 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3728  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  352  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7005  hypothetical protein  48.15 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.452257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39110  hypothetical protein  43.81 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5960  Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)- like protein  37.63 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00069355  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  42.65 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  39.34 
 
 		 245 aa  45.1  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  41.18 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  35.19 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  32.86 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  38.33 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.87 
 
 		 187 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 215 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 184 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 215 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  39.71 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.82 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  31.67 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  37.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>