30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5960 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5960  Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)- like protein  100 
 
 		 341 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00069355  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39110  hypothetical protein  41 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7005  hypothetical protein  37.72 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.452257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3728  hypothetical protein  37.63 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04540  microfilament motor, putative  36.36 
 
 		 1274 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  49.23 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  41.18 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  46.88 
 
 		 201 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  32.18 
 
 		 204 aa  49.3  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  46.88 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  33.98 
 
 		 178 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  49.23 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.38 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 228 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  35.35 
 
 		 204 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  40.58 
 
 		 230 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  40.58 
 
 		 230 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  41.38 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  36.76 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6858  GrpE protein  43.33 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0571011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  43.75 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  41.54 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  24.4 
 
 		 192 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  33.98 
 
 		 187 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  26.83 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  27.36 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  26.98 
 
 		 207 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>