19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7005 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7005  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  240  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.452257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39110  hypothetical protein  63.78 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3728  hypothetical protein  50.53 
 
 		 186 aa  100  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5960  Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)- like protein  37.72 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00069355  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  37.14 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  39.68 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  30.65 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  38.57 
 
 		 286 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  37.14 
 
 		 261 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  37.14 
 
 		 261 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  38.36 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  32.43 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  37.5 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.5 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 		 247 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  30.88 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  34.44 
 
 		 193 aa  40  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.33 
 
 		 207 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>