30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  55.61 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  59.04 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  57.29 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  50.49 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  50 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  55.1 
 
 		 222 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  54.08 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  52.28 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  45.54 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  47.32 
 
 		 243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  54.13 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  51.76 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  51.98 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  50.76 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  48.37 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  47.34 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  56 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  46.57 
 
 		 544 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  40.54 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  37.95 
 
 		 176 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  35.53 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  29.71 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  33.17 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  36.09 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  31.05 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6617  hypothetical protein  31.79 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981466 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  28.07 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>