28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5199 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  49.09 
 
 
219 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  49.12 
 
 
231 aa  204  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  50.64 
 
 
238 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  48.62 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  47.62 
 
 
237 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  47.48 
 
 
247 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  47.64 
 
 
252 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  51.81 
 
 
222 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  47.62 
 
 
245 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  44.74 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  45.06 
 
 
241 aa  161  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  49.7 
 
 
254 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  51.32 
 
 
247 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  44.65 
 
 
230 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  45.75 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  43.37 
 
 
229 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  42.54 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  44.2 
 
 
234 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  41.54 
 
 
544 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  41.34 
 
 
239 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  31.7 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  34.97 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  25.7 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  31.79 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  28.45 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  27.43 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>