28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1253 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  100 
 
 		 230 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  73.64 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  56.6 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  50.93 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  51.4 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  51.87 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  48.25 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  49.55 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  57.07 
 
 		 245 aa  177  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  44.65 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  49.33 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  57.07 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  52.91 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  53.88 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  49.75 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  54.12 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  50.26 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  50.27 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  58.73 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  46 
 
 		 544 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  35.87 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  30.88 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  35.06 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  37.57 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  29 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  27.04 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>