28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  67.53 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  58.01 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  51.1 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  50 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  57.29 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  49.78 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  49.76 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  50.88 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  51.87 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  54.9 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  50.79 
 
 		 222 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  50.53 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  50.26 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  53.57 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  54.12 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  52.04 
 
 		 251 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  49.33 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  54.5 
 
 		 544 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  42.73 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  31.09 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  32.99 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  39.53 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  33.81 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  32.77 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  30.18 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6617  hypothetical protein  29.08 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  27.49 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>