25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1713 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  32.98 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  29.31 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  32.04 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  33.52 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  28.73 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  31.84 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  30.94 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  29.03 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  30.5 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  30.85 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  31.43 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  30.6 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  30.37 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  29.41 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  28.14 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 		 544 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16922  predicted protein  37.88 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  25.64 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  26.97 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  28.99 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>