27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6431 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  66.67 
 
 
222 aa  254  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  52.4 
 
 
231 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  54.33 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  60.73 
 
 
245 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  53.74 
 
 
252 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  50.43 
 
 
241 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  51.74 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  48.03 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  54.43 
 
 
247 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  49.78 
 
 
243 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  52.17 
 
 
247 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  46.52 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  51.3 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  55.69 
 
 
254 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  51.4 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  54.59 
 
 
251 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  45.45 
 
 
238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  49.77 
 
 
234 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  45.99 
 
 
544 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  32.51 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  33.88 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  39.24 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  30.56 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  31.36 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  31.76 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  29.26 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>