29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5365 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  55.9 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  56.16 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  50.51 
 
 		 239 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  55.62 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  62.11 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  56.61 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  53.3 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  54.68 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  52.82 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  56.25 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  57.89 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  49.76 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  52.66 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  52.69 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  49.72 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  52.09 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  48.15 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  51.85 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  44.44 
 
 		 544 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  33.5 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  33.65 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  35.06 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  32.96 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  33.86 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  34.83 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  25.84 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  28.72 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  33.6 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>