28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2159 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  69.15 
 
 
237 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  56.16 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  53.93 
 
 
231 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  57.89 
 
 
245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  51.81 
 
 
239 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  52.33 
 
 
238 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  52.79 
 
 
245 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  57.07 
 
 
252 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  51.52 
 
 
241 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  53.81 
 
 
247 aa  174  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  50.79 
 
 
243 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  55.1 
 
 
254 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  53.54 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  48.47 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  52.91 
 
 
230 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  55.26 
 
 
251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  45.21 
 
 
238 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  52.13 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  46.49 
 
 
544 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  43.98 
 
 
176 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  35.87 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  34.65 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  34.04 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  38.53 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  31.49 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  28.06 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>