32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2684 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  58.01 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  53.14 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  58.55 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  48.05 
 
 		 231 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  52.54 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  51.94 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  52.34 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  42.73 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  52.73 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  46.52 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  50.43 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  51.9 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  49.77 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  54.49 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  55.61 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  45.96 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  48.46 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  55.45 
 
 		 544 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  46.29 
 
 		 230 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5427  hypothetical protein  42.46 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  33.76 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  37.43 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  38.22 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  30.18 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  31.4 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  30.68 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  28.32 
 
 		 242 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  28.32 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  28.32 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  28.32 
 
 		 242 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>