26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1897 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  100 
 
 
246 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  59.66 
 
 
248 aa  269  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  33.86 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  33.81 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  35.11 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  30.67 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  30.35 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  31.52 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  32.81 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  30.88 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  37.23 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  30.48 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  34.55 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  32.17 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  29.17 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  32.98 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  30.16 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  31.22 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  26.52 
 
 
225 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  39.44 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  30.4 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 
544 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  29.41 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  39.71 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1977  hypothetical protein  25.62 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>