22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4217 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6617  hypothetical protein  35.53 
 
 
252 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  30.28 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  27.78 
 
 
225 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  28.73 
 
 
227 aa  55.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  25.63 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  27.78 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  28.04 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  28.04 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  24.79 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  27.51 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  27.51 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  26.77 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.942806 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  29.46 
 
 
269 aa  52  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  26.77 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  25.63 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  31.73 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  29.41 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  28.85 
 
 
237 aa  45.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  23.98 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  33.6 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  31.06 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>