22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2257 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  98.3 
 
 
235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  97.02 
 
 
235 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.942806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  81.51 
 
 
242 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  81.51 
 
 
242 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  81.09 
 
 
242 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  81.09 
 
 
242 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  86.7 
 
 
237 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  82.89 
 
 
238 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  67.29 
 
 
234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  64.91 
 
 
236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  63.48 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  64.25 
 
 
233 aa  275  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  64.11 
 
 
225 aa  271  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  54.59 
 
 
227 aa  228  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1937  hypothetical protein  52.14 
 
 
236 aa  218  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  41.24 
 
 
226 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  30.84 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  26.77 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1655  hypothetical protein  31.21 
 
 
222 aa  49.3  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0155493  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1977  hypothetical protein  24.58 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>