23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2180 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  98.3 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  97.02 
 
 		 235 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  82.48 
 
 		 242 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  82.05 
 
 		 242 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  82.48 
 
 		 242 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  82.05 
 
 		 242 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  87.55 
 
 		 237 aa  384  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  83.33 
 
 		 238 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  309  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  67.76 
 
 		 234 aa  308  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  65.35 
 
 		 236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  65.16 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  64.59 
 
 		 225 aa  274  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  55.5 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1937  hypothetical protein  52.56 
 
 		 236 aa  224  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  40.72 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  29.44 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  26.77 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 269 aa  52  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1655  hypothetical protein  30.64 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0155493  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1977  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153346  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16922  predicted protein  35 
 
 		 235 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>