More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14680  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  141  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  71.91 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 		 91 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  123  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  70.45 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2163  ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12798  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  69.77 
 
 		 88 aa  119  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2082  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151989 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2099  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2145  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2349  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.111159  hitchhiker  0.00348577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  65.12 
 
 		 88 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4024  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1734  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  65.12 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>