138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1252 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1252  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  650    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0876  hypothetical protein  51.81 
 
 
341 aa  341  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0718  hypothetical protein  42.68 
 
 
319 aa  233  5e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1389  hypothetical protein  38.94 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1377  dihydrodipicolinate reductase (dhpr)  37.38 
 
 
328 aa  205  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1250  hypothetical protein  37.5 
 
 
316 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.640847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0488  hypothetical protein  37.19 
 
 
316 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0360823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1371  hypothetical protein  37.19 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0603  hypothetical protein  38.46 
 
 
317 aa  190  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  28.27 
 
 
384 aa  106  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  26.69 
 
 
370 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  26.69 
 
 
370 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  26.69 
 
 
368 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  26.69 
 
 
370 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.46 
 
 
368 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  26.84 
 
 
370 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  26.47 
 
 
370 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  27.16 
 
 
370 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  27.06 
 
 
370 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  29.41 
 
 
370 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  25.89 
 
 
370 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  24.4 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  23.99 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  25.22 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  25.43 
 
 
386 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  24.5 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  24.47 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  25.22 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  23.8 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  23.85 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  23.88 
 
 
385 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  26.94 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  24.05 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  24.72 
 
 
398 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  24.34 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  24.34 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  24.22 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  26.65 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  23.22 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  23.12 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  23.87 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  24.41 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  21.9 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  26.53 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  23.16 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  22.44 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  24.64 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  26.09 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  30.15 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  24.64 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  23.85 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  24.79 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  24.01 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  21.97 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  21.47 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  22.64 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  24.64 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  22.71 
 
 
393 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  32.39 
 
 
400 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  33.99 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  23.32 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  22.7 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  23.32 
 
 
451 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  22.92 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  29.17 
 
 
410 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  31.69 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  22.96 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  32.68 
 
 
396 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  24.54 
 
 
366 aa  63.2  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  28.87 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  29.3 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  23.72 
 
 
405 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  22.88 
 
 
395 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  24.3 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  24.59 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  23.78 
 
 
394 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  22.29 
 
 
395 aa  59.3  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  20.81 
 
 
449 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  23.01 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  28.37 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  28.67 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  31.69 
 
 
401 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  27.27 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  22.67 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.1 
 
 
397 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  26.79 
 
 
379 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  22.33 
 
 
387 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  24.58 
 
 
396 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  27.98 
 
 
376 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  22.05 
 
 
367 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  23.3 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  24.49 
 
 
402 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  21.27 
 
 
410 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  25.17 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  22.36 
 
 
375 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  27.14 
 
 
404 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  23.51 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  23.08 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  20.22 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>