103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1389 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1389  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  665    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1377  dihydrodipicolinate reductase (dhpr)  58.72 
 
 
328 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0718  hypothetical protein  50.46 
 
 
319 aa  294  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0488  hypothetical protein  43.2 
 
 
316 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0360823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1371  hypothetical protein  42.6 
 
 
316 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0876  hypothetical protein  40.59 
 
 
341 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1250  hypothetical protein  41.99 
 
 
316 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.640847  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0603  hypothetical protein  37.85 
 
 
317 aa  228  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1252  hypothetical protein  38.94 
 
 
323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  26.35 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.11 
 
 
368 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  27.03 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  27.05 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  26.35 
 
 
370 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  26.35 
 
 
368 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  25.5 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  26.13 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  26.35 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  25.44 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  24.57 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  26.29 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  27.03 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  26.47 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  26 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0866  protein of unknown function DUF185  30.96 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  24.2 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  25.41 
 
 
394 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  25.09 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  23.85 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  23.23 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  23.77 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  24.79 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  24.37 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  31.72 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  23.43 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  24.32 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  28.37 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  23.63 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  25.61 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  22.57 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  23.19 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  24.84 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  25.6 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  24.46 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  24.68 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  21.36 
 
 
377 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  26.48 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  24.21 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  24.52 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  22.44 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  24.84 
 
 
405 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  29.41 
 
 
377 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  25.27 
 
 
395 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  25.37 
 
 
375 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  25.08 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  28.76 
 
 
377 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  26.09 
 
 
424 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  24.38 
 
 
395 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  25.34 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2151  protein of unknown function DUF185  25.61 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510759  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  23.08 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  24.52 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  23.33 
 
 
386 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  21.96 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  24.45 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  23.23 
 
 
369 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  22.32 
 
 
410 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  22.84 
 
 
368 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  24.16 
 
 
376 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  24.1 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  20.93 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  24.04 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  23.02 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  20.87 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  23.53 
 
 
397 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  26.09 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  23.96 
 
 
370 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  22.18 
 
 
355 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  26.56 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  22.49 
 
 
356 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  24.08 
 
 
384 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  21.96 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  22.15 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  23.44 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  25.87 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  22.58 
 
 
386 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  25 
 
 
401 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  23.62 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  21.52 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  24.31 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  21.78 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  20.82 
 
 
366 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  22.19 
 
 
393 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  23.72 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  22.58 
 
 
400 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  20 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  24.09 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  22 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  24.29 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  22.62 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>