75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3253 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3253  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3007  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  42.86 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.22558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4279  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  42.75 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3427  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  38.52 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000026187  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1271  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  34.75 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0303199  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1315  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  37.63 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  0.28147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3024  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  33.33 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3862  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  33.49 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3950  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.82 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3207  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  31.49 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4100  PTS system sorbose-specific iic component  31.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.95492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4049  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIC  31.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0479771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3977  PTS system sorbose-specific iic component  31.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3995  PTS system sorbose-specific iic component  31.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.850297  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4163  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIC  31.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.76822  normal  0.445154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3275  PTS system sorbose-specific IIC component  30.84 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2967  PTS system, IIC component  27.92 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0950  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.73 
 
 		 247 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0133  phosphotransferase system PTS, sorbose-specific IIC subunit  30.37 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3476  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  28.63 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.482884  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0687  PTS system PTS, sorbose-specific IIC subunit  27.17 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0430077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0628  PTS sorbose-specific transporter subunit IIC  27.17 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2098  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  28.83 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0515  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  27.98 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0380  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  31.84 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0152  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  25.98 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3846  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  26.67 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3401  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  26.07 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000146496  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0346  PTS system, IIC component  26.81 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3324  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  30.09 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02999  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIC component of PTS  30.09 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3431  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  30.09 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0566  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.09 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4448  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  30.09 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02950  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3614  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  30.09 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2388  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.13 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4951  PTS system transporter subunit IIC  25.65 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242204  normal  0.340025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4945  phosphotransferase enzyme II C component  25.65 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3574  phosphotransferase system PTS, sorbose-specific IIC subunit  29.15 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.579302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4791  phosphotransferase enzyme II C component  25.65 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.499684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4892  PTS system transporter subunit IIC  26.02 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1994  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC subunit  24.73 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206509  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0118  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  27.82 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197057  decreased coverage  7.59057e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02957  hypothetical protein  24.9 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3438  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  24.9 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03006  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIC component of PTS  24.9 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0559  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  24.9 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0991  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  26.67 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3373  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC component  25.83 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.906209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3621  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  24.9 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3331  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  24.9 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.5681  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0939  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIC component  26.67 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0566  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC subunit  24.9 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3398  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  25.62 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3580  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  24.18 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal  0.210222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3698  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  25.66 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000371279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5495  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC component  25.7 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4518  sorbose-permease PTS system IIC component  25.64 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4478  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  25.23 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1100  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  26.03 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220553  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1065  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.26 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1715  PTS system, IIC component  25 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1932  PTS family phosphotransferase mannose-specific enzyme IIC  30.82 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.118709  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0608  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (mannose-specific phosphotransferase system IIC component)  25.29 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00148222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0402  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  25 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.901281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1949  PTS system, IIC component  24.51 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0398  PTS system sorbose-specific IIC subunit  25 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0571  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.77 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0450  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  24.3 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.151215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1899  PTS system, IIC component  24.08 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2814  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  27.02 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396731 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0128  hypothetical protein  32.35 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551521 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1300  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  24.72 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0212  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  25 
 
 		 265 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>