68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0133 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0133  phosphotransferase system PTS, sorbose-specific IIC subunit  100 
 
 
259 aa  501  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3862  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  38.72 
 
 
251 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3207  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  41.04 
 
 
246 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4163  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIC  35.86 
 
 
249 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.76822  normal  0.445154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3995  PTS system sorbose-specific iic component  35.86 
 
 
249 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.850297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3977  PTS system sorbose-specific iic component  35.86 
 
 
249 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4100  PTS system sorbose-specific iic component  35.86 
 
 
249 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.95492  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4049  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIC  35.86 
 
 
249 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0479771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3275  PTS system sorbose-specific IIC component  35.44 
 
 
249 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3024  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  36.07 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3007  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.74 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.22558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4279  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.52 
 
 
266 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0152  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  27.23 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3253  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.37 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3950  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  33.33 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3401  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  27.06 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000146496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3373  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC component  25.21 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.906209 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1065  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  28.14 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0950  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.49 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0939  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIC component  25.21 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0991  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  25.21 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3846  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  26.56 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3427  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.46 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000026187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3324  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  26.79 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3614  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  26.79 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02950  hypothetical protein  26.79 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4448  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  26.79 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601715  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02999  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIC component of PTS  26.79 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0566  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  26.79 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3431  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  26.79 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1715  PTS system, IIC component  29.76 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3398  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  24.77 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0118  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  30.46 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197057  decreased coverage  7.59057e-25 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2388  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  25.89 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0515  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  27.11 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138183  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3574  phosphotransferase system PTS, sorbose-specific IIC subunit  25.45 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.579302 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0687  PTS system PTS, sorbose-specific IIC subunit  25.93 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0430077  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0628  PTS sorbose-specific transporter subunit IIC  25.93 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2098  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  27.98 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3698  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  25.19 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000371279  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1100  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  26.61 
 
 
534 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1949  PTS system, IIC component  26.87 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0380  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  28.5 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2967  PTS system, IIC component  25.88 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0398  PTS system sorbose-specific IIC subunit  27.38 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0402  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  27.38 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.901281  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0346  PTS system, IIC component  27.8 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1994  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC subunit  23.57 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206509  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1315  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.58 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  0.28147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3580  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  24.62 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal  0.210222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03006  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIC component of PTS  25.55 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0566  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC subunit  25.55 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3331  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  25.55 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.5681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3621  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  25.55 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0559  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  25.55 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02957  hypothetical protein  25.55 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3438  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  25.55 
 
 
267 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4478  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  24.31 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1899  PTS system, IIC component  28.38 
 
 
288 aa  55.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00676289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4518  sorbose-permease PTS system IIC component  22.69 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5495  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC component  23.85 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4892  PTS system transporter subunit IIC  25.71 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4945  phosphotransferase enzyme II C component  25.71 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4791  phosphotransferase enzyme II C component  25.71 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.499684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4951  PTS system transporter subunit IIC  25.71 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242204  normal  0.340025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3476  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  26.92 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.482884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1271  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  24.29 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0303199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0571  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.29 
 
 
133 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>