69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1932 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1932  PTS family phosphotransferase mannose-specific enzyme IIC  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.118709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0155  hypothetical protein  34.9 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.206055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0168  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  36.11 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0157  hypothetical protein  36.11 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0687  PTS system PTS, sorbose-specific IIC subunit  32.26 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0430077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0628  PTS sorbose-specific transporter subunit IIC  32.26 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0150  hypothetical protein  52.38 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.567268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0128  hypothetical protein  29.68 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3950  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.77 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0991  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  32.82 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0939  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIC component  32.82 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1994  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC subunit  30.08 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3846  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  36.28 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4478  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  30.33 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4518  sorbose-permease PTS system IIC component  30.83 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5495  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC component  30.33 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3373  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC component  32.31 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.906209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2098  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  28.04 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1100  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  28.57 
 
 		 534 aa  53.1  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4892  PTS system transporter subunit IIC  50 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3401  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  35.79 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000146496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4945  phosphotransferase enzyme II C component  50 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4791  phosphotransferase enzyme II C component  50 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.499684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4951  PTS system transporter subunit IIC  50 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242204  normal  0.340025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4100  PTS system sorbose-specific iic component  32.46 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.95492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1065  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  26.92 
 
 		 268 aa  52  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3698  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  28.57 
 
 		 270 aa  52  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000371279  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4163  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIC  32.46 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.76822  normal  0.445154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3995  PTS system sorbose-specific iic component  32.46 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.850297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3977  PTS system sorbose-specific iic component  32.46 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4049  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIC  32.46 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0479771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2388  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  38.16 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02999  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIC component of PTS  38.16 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4448  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  38.16 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3324  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  38.16 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3614  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  38.16 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02950  hypothetical protein  38.16 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3431  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  38.16 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0566  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  38.16 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3253  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.82 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0571  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  37.18 
 
 		 133 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0152  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  43.86 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3207  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  28.45 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3275  PTS system sorbose-specific IIC component  29.31 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3398  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  28.17 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370067  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0450  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  37.88 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.151215  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0212  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  39.34 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3476  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  40 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.482884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1767  mannose-specific PTS system component IIC  30.08 
 
 		 268 aa  48.5  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.380905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1949  PTS system, IIC component  39.13 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3574  phosphotransferase system PTS, sorbose-specific IIC subunit  36.49 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.579302 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3862  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30.77 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0380  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  28.8 
 
 		 311 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1715  PTS system, IIC component  45.83 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0346  PTS system, IIC component  27.64 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3580  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  30.36 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal  0.210222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2814  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIC subunit  32.52 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0608  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (mannose-specific phosphotransferase system IIC component)  33.33 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00148222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3024  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  30 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0118  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  29.77 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197057  decreased coverage  7.59057e-25 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03006  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIC component of PTS  37.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0566  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC subunit  37.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2967  PTS system, IIC component  28.46 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3331  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  37.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.5681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3621  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  37.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0559  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  37.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02957  hypothetical protein  37.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3438  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC  37.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIC subunit  31.71 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.439361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>